Normalerweise erkennt vim den Dateityp einer Datei sehr zuverlässig und wendet das richtige Syntaxhighlighting an. Dieses normalerweise schließt allerdings nicht unbedingt das Lösen von merge-Konflikten mit ein, so dass für diese Fälle der Dateityp manuell gesetzt beziehungsweise das richtige Syntaxhighlighting aktiviert werden muss. Dazu gibt es den Befehl :set syntax=[Syntaxkürzel].
Um also beispielsweise das Syntaxhighlighting einer Datei auf Php zu stellen, muss

:set syntax=php

eingegeben werden.

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Forcing Syntax Coloring for files with odd extensions

Danke, Jan!